Vláda Slovenskej republiky prijala záväzok definitívne odstaviť bloky JE V1, postupne blok 1 v roku 2006 a blok 2 v roku 2008.

Odstavením oboch blokov JE V1 v roku 2006, resp 2008 začala etapa ukončovania prevádzky, ktorá je definovaná ako časový úsek začínajúci konečným odstavením 1. bloku, pokračujúci konečným odstavením 2. bloku a končiaci po splnení technických a legislatívnych opatrení, získaním povolenia na vyraďovanie od ÚJD SR.

Úrad jadrového dozoru SR vydal Rozhodnutie o povolení na I. etapu vyraďovania jadrového zariadenia JE V1 V utorok 19. júla 2011 vydal ÚJD SR Rozhodnutie č. 400/2011, ktorým povoľuje I. etapu vyraďovania jadrovej elektrárne V1 (JE) V1) v Jaslovských Bohuniciach.

V nedeľu 9. septembra 2007 bola zrealizovaná preprava vyhoreného jadrového paliva z Mochoviec (SE-EMO) do Medziskladu vyhoreného paliva v Jaslovských Bohuniciach (JAVYS). Preprava bola vykonaná v súlade s legislatívnymi požiadavkami a v súčinnosti so zložkami ministerstiev dopravy a vnútra.